人工合成酵母染色體,意義何在?
曾參與人類基因組測(cè)序計(jì)劃的華大基因理事長(zhǎng)楊煥明院士介紹說,合成生物學(xué)(Synthetic Biology)是繼“DNA雙螺旋發(fā)現(xiàn)”和“人類基因組測(cè)序計(jì)劃”之后,以基因組設(shè)計(jì)合成為標(biāo)志的第三次生物技術(shù)革命。他指出,生物學(xué)界內(nèi)最重要的分類依據(jù),既不是植物和動(dòng)物,也不是多細(xì)胞和單細(xì)胞生物,而是以原核生物和真核生物來區(qū)分?!凹?xì)菌、病毒等原核生物的基因組相對(duì)簡(jiǎn)單,而動(dòng)物、植物、真菌等等真核生物的基因(DNA)既豐富又復(fù)雜,通常會(huì)包含數(shù)億至甚至數(shù)十億堿基對(duì)信息。同時(shí),作為遺傳物質(zhì)的DNA通常被分配到不同的染色體中,而這些染色體又深藏在細(xì)胞核的特定區(qū)域。所以,合成一個(gè)真核生物的基因組是一項(xiàng)非常艱巨的任務(wù)。但是,如果生物學(xué)真正做到引領(lǐng)技術(shù)革命,合成真核生物基因組技術(shù)必將發(fā)揮非常核心的作用。”
為完成設(shè)計(jì)和化學(xué)再造完整的釀酒酵母基因組,國(guó)際科學(xué)界發(fā)起了釀酒酵母基因組合成計(jì)劃(Sc2.0計(jì)劃),這是合成基因組學(xué)(Synthetic genomics)研究的標(biāo)志性國(guó)際合作項(xiàng)目。該項(xiàng)目由美國(guó)科學(xué)院院士杰夫·伯克發(fā)起,有美國(guó)、中國(guó)、英國(guó)、法國(guó)、澳大利亞、新加坡等多國(guó)研究機(jī)構(gòu)參與并分工協(xié)作,試圖重新設(shè)計(jì)并合成釀酒酵母的全部16條染色體(長(zhǎng)約12Mb,1Mb是百萬堿基對(duì))。
天津大學(xué)化工學(xué)院教授元英進(jìn)是最早參與該計(jì)劃的中國(guó)科學(xué)家,此次在《科學(xué)》期刊上以通訊作者身份發(fā)表了2篇論文。他告訴記者,如同科學(xué)實(shí)驗(yàn)中經(jīng)常使用的果蠅、斑馬魚,釀酒酵母是生物學(xué)研究中的“模式真核單細(xì)胞生物”?!叭绻f病毒基因組的合成開啟了基因組化學(xué)合成研究,那么原核生物和真核生物基因組合成研究的不斷突破,則初步實(shí)現(xiàn)了化學(xué)全合成基因組對(duì)單細(xì)胞原核生物和真核生物的生命調(diào)控?!搬劸平湍甘堑谝粋€(gè)被全基因組測(cè)序的真核生物,大尺度的設(shè)計(jì)和重建酵母基因組是對(duì)目前酵母領(lǐng)域知識(shí)貯備的真實(shí)性、完整性和準(zhǔn)確性的一個(gè)直接考驗(yàn)?;瘜W(xué)合成酵母,一方面可以幫助人類更深刻地理解一些基礎(chǔ)生物學(xué)的問題,另一方面可以通過基因組重排系統(tǒng),使酵母實(shí)現(xiàn)快速進(jìn)化,得到在醫(yī)藥、能源、環(huán)境、農(nóng)業(yè)、工業(yè)等領(lǐng)域有重要應(yīng)用潛力的菌株。”