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如果病人查體或者進行治療時發(fā)現(xiàn)腎臟膿腫，吃口服藥物效果不理想，必須靜脈應(yīng)用藥物。如果囊腫較小，無法進行穿刺抽樣來診斷感染造成膿腫的病原微生物種類，就需要靜脈根據(jù)經(jīng)驗來應(yīng)用喹諾酮類的藥物、β-內(nèi)酰胺類抗生素或者某些厭氧菌類的藥物來進行治療，絕大多數(shù)可明顯好轉(zhuǎn)。如果囊腫出現(xiàn)感染，也就是發(fā)生膿腫，條件允許時可做穿刺抽液做相應(yīng)的膿液培養(yǎng)，根據(jù)膿液培養(yǎng)的結(jié)果來應(yīng)用相應(yīng)的藥物。絕大多數(shù)采用喹諾酮類的藥物、β-內(nèi)酰胺類的藥物或者某些厭氧菌的藥物進行治療。進行藥物治療的同時也需要尋找造成腎膿腫的原因，是囊腫感染造成，還是由于機體其他系統(tǒng)異常造成機體免疫力低下而引起。往往這種情況發(fā)生在糖尿病患者身上較多，因為糖尿病容易造成尿液中葡萄糖增加，細菌容易在含有糖分增高的尿液中繁殖，從而出現(xiàn)泌尿系統(tǒng)感染。糖尿病的病人由于機體抵抗力下降容易出現(xiàn)腎膿腫，而且有部分腎膿腫可以在腎臟出現(xiàn)多發(fā)的情況。這是由于血液傳播造成，需要尋找原因才能使腎膿腫得到徹底的治療。