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被檢測者進行核酸檢測難受與否，決定于如何獲取的核酸標本。病原體核酸檢測標本可以用咽拭子或鼻咽拭子取到上呼吸道標本，也可以用痰液進行核酸檢測。如檢測被檢測者的痰液，可能無任何不適。而若被檢測者通過鼻咽拭子或咽拭子進行檢測時，可能會有不適癥狀，如咽部不適或取標本時由于咽部刺激會有咳嗽癥狀。所以被檢測者進行咽拭子或鼻咽拭子時，會有一定不適，但是被檢測者能耐受此不適感，而且也不會有后遺癥存在，被檢測者無需擔心。