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不同炎癥性疾病中C反應蛋白變化存在差異，克羅恩病是一種腸道非特異性炎癥反應疾病，所以C反應蛋白在克羅恩病中的應用，主要作為評估克羅恩病疾病活動期輔助指標。 C反應蛋白是在機體受到感染或組織損傷時，血漿中急劇上升蛋白質。臨床經常把C反應蛋白檢測作為一種炎癥感染評估指標，其作為急性反應蛋白，已被臨床廣泛應用于評估各種炎癥性疾病活動期。此外，小腸病變C反應蛋白升高，顯著低于結腸類型克羅恩病。